Milli İdman Tibb Reabilitasiya İnstitutunda elmi-tədqiqat işlərin əsas istiqamətləri:
- İdman tibbi
- Yayılmış xəstəliklər və somatik pozğunluqları olan xəstələrin reabilitasiyası və ikincili profilaktika
- Preventiv təbabət və ya praktik sağlam insanlarda birincili profilaktika